个人简历

教学工作
[1] 离散数学（本科课程）
[2] 软件体系结构（本科课程）
[3] 软件工程概论（本科课程）
[4] 高级算法设计与分析（硕士课程；课程负责人）
[5] 高级软件体系结构（硕士课程；课程负责人）
[6] 算法设计与复杂度理论（博士课程；课程负责人）
教育背景
2009-2014年，美国加州大学河滨分校计算机与工程系，博士（导师：Tao Jiang教授和Thomas Girke教授）
2006-2009年，北京交通大学软件学院，硕士
2002-2006年，北京交通大学计算机与信息技术学院，本科
工作经历
2014年至今，北京交通大学软件学院副教授、博士生导师，交叉信息研究团队负责人，中国计算机学会和人工智能学会会员，研究方向为基于大数据的算法和人工智能应用，应用领域主要包括智慧交通和生物医学

研究领域

软件工程（专业学位）
软件工程"科研项目
正在主持和主持过10余项科研项目，还参与过科技部重大专项和美国国家自然科学基金项目"

近期论文

论文/期刊
代表性论文（共同第一作者#，通讯作者*）：
[1] Ergude Bao*, Fei Xie, Changjin Song, Dandan Song*. FLAS: fast and high throughput algorithm for PacBio long read self-correction. Bioinformatics (special track for RECOMB-Seq), 2019
[2] Ergude Bao#*, Changjin Song#, Lingxiao Lan. ReMILO: reference assisted misassembly detection algorithm using short and long reads. Bioinformatics. 2018
[3] Ergude Bao#*, Lingxiao Lan#. HALC: High throughput algorithm for long read error correction. BMC Bioinformatics, 2017
[4] Ergude Bao, Tao Jiang, Thomas Girke*. AlignGraph: algorithm for secondary de novo genome assembly guided by closely related references. Bioinformatics (special issue for ISMB), 2014
[5] Ergude Bao, Tao Jiang, Thomas Girke*. BRANCH: boosting RNA-Seq assemblies with partial or related genomic sequences. Bioinformatics, 2013
[6] Ergude Bao, Tao Jiang, Isgouhi Kaloshian, Thomas Girke*. SEED: efficient clustering of next generation sequences. Bioinformatics, 2011
[7] 包尔固德*, 李伟生, 范东睿, 杨扬, 马啸宇. Godson-T众核体系结构上的Broadcast性能优化. 计算机研究与发展, 2010
[1] 国家自然科学基金评审人
[2] Bioinformatics期刊审稿人
[3] ISMB会议审稿人